Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms