Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ribc2Q9D4Q1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms