Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrp2bpQ9D4C6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms