Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms