Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc6bQ9D289 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms