Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bcas2Q9D287 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bcas2Q9D287 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms