Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Lmbr1lQ9D1E5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbr1lQ9D1E5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms