Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ift27Q9D0P8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ift27Q9D0P8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ift27Q9D0P8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift27Q9D0P8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ift27Q9D0P8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ift27Q9D0P8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Ift27Q9D0P8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Ift27Q9D0P8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ift27Q9D0P8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ift27Q9D0P8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift27Q9D0P8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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