Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem88Q9D0N8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem88Q9D0N8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem88Q9D0N8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem88Q9D0N8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem88Q9D0N8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem88Q9D0N8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem88Q9D0N8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem88Q9D0N8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem88Q9D0N8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem88Q9D0N8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem88Q9D0N8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem88Q9D0N8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem88Q9D0N8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem88Q9D0N8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem88Q9D0N8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem88Q9D0N8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem88Q9D0N8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem88Q9D0N8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem88Q9D0N8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem88Q9D0N8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem88Q9D0N8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem88Q9D0N8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem88Q9D0N8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem88Q9D0N8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem88Q9D0N8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem88Q9D0N8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem88Q9D0N8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem88Q9D0N8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem88Q9D0N8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem88Q9D0N8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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