Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I8

Mrto4, mRNA turnover protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrto4Q9D0I8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrto4Q9D0I8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrto4Q9D0I8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrto4Q9D0I8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrto4Q9D0I8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrto4Q9D0I8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrto4Q9D0I8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mrto4Q9D0I8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrto4Q9D0I8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrto4Q9D0I8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mrto4Q9D0I8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrto4Q9D0I8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrto4Q9D0I8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrto4Q9D0I8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrto4Q9D0I8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrto4Q9D0I8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrto4Q9D0I8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrto4Q9D0I8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrto4Q9D0I8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrto4Q9D0I8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrto4Q9D0I8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrto4Q9D0I8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrto4Q9D0I8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrto4Q9D0I8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrto4Q9D0I8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms