Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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