Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ04

Cops7a, COP9 signalosome complex subunit 7a, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7aQ9CZ04 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cops7aQ9CZ04 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops7aQ9CZ04 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cops7aQ9CZ04 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cops7aQ9CZ04 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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