Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms