Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYB0

Trim13, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM13, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim13Q9CYB0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim13Q9CYB0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms