Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mis12Q9CY25 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mis12Q9CY25 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms