Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bud23Q9CY21 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bud23Q9CY21 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bud23Q9CY21 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bud23Q9CY21 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bud23Q9CY21 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bud23Q9CY21 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bud23Q9CY21 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bud23Q9CY21 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Bud23Q9CY21 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bud23Q9CY21 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bud23Q9CY21 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bud23Q9CY21 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bud23Q9CY21 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bud23Q9CY21 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bud23Q9CY21 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bud23Q9CY21 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bud23Q9CY21 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bud23Q9CY21 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bud23Q9CY21 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bud23Q9CY21 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms