Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx7Q9CY18 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms