Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Yif1bQ9CX30 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms