Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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