Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prkrip1Q9CWV6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prkrip1Q9CWV6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prkrip1Q9CWV6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prkrip1Q9CWV6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prkrip1Q9CWV6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prkrip1Q9CWV6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prkrip1Q9CWV6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prkrip1Q9CWV6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms