Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CWU4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CWU4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CWU4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CWU4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CWU4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CWU4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CWU4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CWU4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms