Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tdrd12Q9CWU0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd12Q9CWU0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms