Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NubplQ9CWD8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms