Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW46

Raver1, Ribonucleoprotein PTB-binding 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver1Q9CW46 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Raver1Q9CW46 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms