Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atxn3Q9CVD2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn3Q9CVD2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms