Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Sycp2Q9CUU3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sycp2Q9CUU3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms