Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf1Q9CUN6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smurf1Q9CUN6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms