Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms