Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcf1Q9CTH6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcf1Q9CTH6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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