Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms