Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gnpda2Q9CRC9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms