Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q9CRC3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q9CRC3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q9CRC3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CRC3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CRC3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CRC3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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