Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl28Q9CR40 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms