Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR16

Ppid, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpidQ9CR16 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PpidQ9CR16 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpidQ9CR16 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms