Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifitm3Q9CQW9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ifitm3Q9CQW9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms