Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Chchd5Q9CQP3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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