Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rwdd1Q9CQK7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rwdd1Q9CQK7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms