Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DenrQ9CQJ6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DenrQ9CQJ6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms