Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ergic3Q9CQE7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ergic3Q9CQE7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ergic3Q9CQE7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ergic3Q9CQE7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ergic3Q9CQE7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ergic3Q9CQE7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ergic3Q9CQE7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ergic3Q9CQE7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ergic3Q9CQE7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ergic3Q9CQE7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms