Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rab5aQ9CQD1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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