Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc5Q9CQA1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc5Q9CQA1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms