Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
StambpQ9CQ26 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms