Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms