Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bcl11bQ99PV8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms