Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim26Q99PN3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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