Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tdrd1Q99MV1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms