Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrtQ99MR6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms