Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp1b1Q99LU0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chmp1b1Q99LU0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms