Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ciao1Q99KN2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms