Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab28Q99KL7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms